Deep Genomics是一家加拿大公司,利用机器学习来追踪潜在的遗传因素,动脉网获悉,5月3日,公司对外宣布正式将技术应用于药物研发。他们的技术可以通过在大量基因组数据中发现微妙的信号来帮助生产强大的新药。
Deep Genomics由多伦多大学教授Brendan Frey创立,专门从事机器学习和基因组学。他的公司使用深度学习或非常大的神经网络来分析基因组数据。通过识别一种或多种负责疾病的基因帮助研究人员开发一种能够解决错误基因行为的药物。
到目前为止,该公司已经专注于研究可能与特定疾病有关系的难以检测的突变基因组。该公司首先将重点关注在孟德尔病症早期药物研发。孟德尔病症是遗传性疾病,由单一遗传突变引起的。全球有3.5亿人与此病有关。
五年左右,要成功的制药公司必须使用这些AI工具
将AI技术应用于药物开发主要原因是由于强大的新算法的出现,而且还是通过降低成本、提高效率对整个基因组进行排序。Frey表示:“数据丰富,以信息为基础的医学开创了新时代。“你可以获得很多不同类型的数据。而我们处理大量数据的最佳技术是机器学习和人工智能。”
近年来,深入学习已成为使用大量培训数据查找抽象模式有力的工具,目前已被证明对语音识别、分类特别有价值。该方法也提供了一种在医学图像中发现疾病的方法,并且已经可以从患者记录中预测疾病。
Frey以前是计算机科学家,曾在多伦多大学攻读深入学习,他表示Deep Genomics将寻求与制药公司合作进行药物开发。Deep Genomics主要提供专业知识。
Frey表示: “五年左右,要成功的制药公司必须使用这些AI工具。”
Deep Genomics还专门在人类基因组中发现难以捉摸和不太直接的疾病触发因素。例如,该公司已经发表了一些成果,展示了如何利用深入学习帮助识别DNA中有助于脊髓性肌肉萎缩和非息肉性结肠直肠癌等疾病的基因。
美国旧金山UCSF医学院助理教授斯蒂芬·桑德斯,专门研究使用基因组学和生物信息学来研究疾病,他说,深入学习可以通过在稀疏病理学数据与大型基因组数据集合中,寻找机会来帮助药物开发。
除了Deep Genomics,其他几家公司也将机器学习应用于药物开发。包括英国公司BenevolentAI,以及字母表的子公司Calico。
BenevolentAI创始人Ken Mulvany说,他的公司专注于炎症和神经退行性疾病,孤儿疾病和罕见的癌症。它是利用大部分未使用的研究数据。Mulvany说:“开发药物仍然是一个非常冗长,危险且昂贵的过程,具有高消耗率。“但是,没有任何开发计划的公司研发机构中有大量尚未开发的数据。”