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将人工智能嵌入生物学

Embedding AI in biology

Nature 等信源发布 2024-08-09 01:04

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Advanced artificial intelligence approaches are rapidly transforming how biological data are acquired and analyzed.

先进的人工智能方法正在迅速改变生物数据的获取和分析方式。

As editors of a journal devoted to method development in the life sciences, we — just like the communities we serve — have been bracing for a wave of advanced computational approaches that will affect almost all branches of biology. This is not a recent trend, as reflected by several editorials featured in our journal in the past few years, as well as the Method of the Year 2021 celebrating the groundbreaking achievement of high-accuracy protein structure prediction.

作为一本致力于生命科学方法开发的期刊的编辑,我们——就像我们服务的社区一样——一直在准备迎接一波将影响几乎所有生物学分支的先进计算方法。这不是最近的趋势,正如我们期刊在过去几年发表的几篇社论以及2021年庆祝高精度蛋白质结构预测突破性成就的方法所反映的那样。

However, the remarkable prowess and rapid evolution of computational methods, such as generative artificial intelligence (AI) and large language models, inspired us to present this Focus issue, which highlights both innovative new methods and opinions from thought leaders in their respective communities.The subject of advanced AI approaches is incredibly rich and complex.

然而,计算方法(如生成人工智能(AI)和大型语言模型)的非凡能力和快速发展启发了我们提出这个焦点问题,它突出了创新的新方法和各自社区思想领袖的观点。高级人工智能方法的主题非常丰富和复杂。

Although we cover a wide palette of topics in this issue, we acknowledge that the Focus is by no means fully comprehensive. Before delving into our series of Comments that discuss the potential effects of AI across diverse fields, we invite you to read a primer from James Zou and colleagues that introduces language models — one of the most impactful recent developments in machine learning — and their burgeoning applications in biological research1.Advanced machine learning approaches are data hungry.

虽然我们在本期中涵盖了广泛的主题,但我们承认重点绝不是全面的。在深入研究我们讨论人工智能在不同领域的潜在影响的一系列评论之前,我们邀请您阅读James Zou及其同事的入门,介绍语言模型(机器学习中最具影响力的最新发展之一)及其在生物学研究中的新兴应用1。先进的机器学习方法需要数据。

With the fast pace of development of high-throughput omics technology (especially at the single-cell level), massive datasets that profile different molecular modalities from millions of cells provide ideal data sources for model training. In a Perspective, Fabian Theis and colleagues provide a comprehensive overview of transformers (a powerful deep learning architecture) and their applications in single-cell analysis2.

随着高通量组学技术(尤其是单细胞水平)的快速发展,从数百万个细胞中分析不同分子模式的大量数据集为模型训练提供了理想的数据源。从一个角度来看,Fabian Theis及其同事全面概述了transformers(一种强大的深度学习体系结构)及其在单细胞分析中的应用2。

Built by devising pretr.

通过设计pretr构建。

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Nat Methods 21, 1365–1366 (2024). https://doi.org/10.1038/s41592-024-02391-7Download citationPublished: 09 August 2024Issue Date: August 2024DOI: https://doi.org/10.1038/s41592-024-02391-7Share this articleAnyone you share the following link with will be able to read this content:Get shareable linkSorry, a shareable link is not currently available for this article.Copy to clipboard.

Nat方法211365-1366(2024)。https://doi.org/10.1038/s41592-024-02391-7Download引文发布日期:2024年8月9日发布日期:2024年8月OI:https://doi.org/10.1038/s41592-024-02391-7Share本文与您共享以下链接的任何人都可以阅读此内容:获取可共享链接对不起,本文目前没有可共享的链接。复制到剪贴板。

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