PacBio发表长读长染色体构象捕获技术CiFi，只需数万细胞即可实现染色体规模组装

加州大学戴维斯分校与PacBio公司合作开发了一种名为CiFi的长读长染色体构象捕获技术，该技术结合了3C技术和PacBio HiFi长读长测序。CiFi能够从低至60,000个细胞（亚微克DNA）中生成数千bp的HiFi reads，包含多个相互作用的基因片段，从而在处理复杂重复序列的同时更准确地绘制基因图谱，并提升了对单倍型的相位分析能力。相比传统的Hi-C技术，CiFi需要更少的样本量，并且在人类细胞和小昆虫中的应用证明了其在解决染色质相互作用方面的改进。通过使用高保真度的PCR酶来富集未发生交联的DNA分子，CiFi显著提高了原始序列产量和标准测序性能的reads长度，平均达到105kbp，并转化为高质量的HiFi数据。这一新技术为基因组组装、单倍型确定及三维染色质结构的研究提供了新的工具。