Genome Biol  CAS9切割不仅改序列，还改“记忆”：李墨团队发现 DNA断裂重塑表观遗传状态

李墨团队在《Genome Biology》发表的研究发现，CRISPR-Cas9 诱导的 DNA 双链断裂不仅改变遗传序列，还会扰乱局部表观遗传信息，导致 DNA 甲基化维持失败，产生稳定且可遗传的表观遗传重塑。该研究填补了基因编辑领域的一项长期空白，并对未来临床基因治疗的安全性评估具有关键意义。通过纳米孔长读长测序技术结合改良的 Cas9-assisted targeted sequencing (CTS) 流程，研究团队实现了单分子、单等位基因水平的序列-甲基化双层解析，揭示了多个基因组背景下的 DNA 序列变异与单碱基分辨率甲基化信息。这些结果表明，Cas9 诱导的双链断裂对印记基因、异染色质区域及肿瘤相关基因的表观遗传状态有显著影响。