公共技术平台质谱团队研发快速血小板多组学新方法，助力肝癌早期

复旦大学上海医学院公共技术平台/生物医学研究院质谱子平台在《Analytical Chemistry》上发表了一种新的快速多组学样本制备方法（IAU-MOSP），该方法能够在6小时内完成蛋白质组、代谢组和脂质组的同步分析，特别适用于血小板等少量珍贵样本。研究团队通过比较四种常用溶剂提取方法，发现MMW法（甲基叔丁基醚/甲醇/水）在脂质和代谢物提取效率上具有显著优势，并将其与快速蛋白质组样品制备方法（RSP）结合，实现了高效多组学分析。该方法使用常规试剂，无需特殊仪器设备，具有良好的实验室间可推广性和自动化转化潜力。研究团队将该方法应用于31例早期肝细胞癌患者和37例健康对照的血小板样本分析，结果显示多组学数据具有良好重复性，且蛋白质组与脂质组、代谢组之间存在强相关性。通过差异表达分析和机器学习，筛选出一个包含6种蛋白质的标志物组合，为肝癌早期诊断提供了新的技术手段。