一、产品名称
智因AI大模型——“智因大脑”

二、产品领先性/创新性
智因AI大模型——“智因大脑” 已助力发现18个人类新致病基因，充分证明了“智因大脑”的超强能力。

三、产品介绍
智因东方构建 40 万人 WES/WGS 基因-表型遗传病大数据，提升遗传病阳性诊断率，智因东方深耕遗传病行业十余年，构建了全球最大的中国人种 WES/WGS 基因-表型数据库，其中患者数据 >20万，正常人数据 >20万，可提供真实世界证据，解决临床遗传病困扰的 VUS 问题，大幅提升遗传病诊断阳性率。智因东方结合遗传病大数据、人工智能技术和独家自研算法，自主研发智因AI大模型——“智因大脑”，可实现从原始数据到变异位点的自动分析和筛选，与人工筛选结果符合率超 99%，真正实现遗传病数据的“全自动”精准快速分析。智因AI大模型——“智因大脑”可为临床提供遗传病数据聚类和挖掘服务可助力数据挖掘和科研成果转化，是临床临床诊断和科研发现的好助手。自 2021年以来，智因东方已助力发现 18个人类新致病基因，为多个遗传病家庭明确了病因，也为多个遗传病的机制探究提供
了方向。

四、产品创新性
智因东方严控质量标准，自主优化实验流程和生信分析算法，可达到远超行业标准的数据结果：（1）智因WES产品测序数据量平均≥10G，Q30 ≥ 85%，目标区域捕获效率≥ 70%，比对率≥99%，覆盖到目标区域的测序平均深度≥ 100X，碱基20X 以上覆盖率> 97%；（2）智因WGS产品测序数据量每个样本≥ 90G，Q30 ≥ 90%，碱基20X 以上覆盖率≥ 90%，测序平均深度≥ 30X，线粒体平均深度≥ 20000X。

为保证 WES/WGS 数据分析的准确性和精准度，智因东方生物信息分析团队一直进行算法更新和优
化，主要包括：（1）采用自研优化的污染质控算法，准确识别样本交叉污染，大大提升变异分析质量；
（2）基于17个exon CNV 算法特征和5万qPCR 验证结果，结合机器学习算法，大大提高exon-CNV
的检出准确率，WES可实现2个连续外显子敏感性>85%，3 个连续外显子敏感性>95%，>30%嵌合的 >10MB CNV敏感性>99%，WGS 可实现特异性≥99%，>10kb 敏感性分析≥99%，>15% 嵌合的>5MB 敏感性 >99%；（3）基于二项式概率统计模型和区域BAF 分布，整合父母VAF，准确识别单亲同二体、单亲异二体和ROH；（4）基于动态突变检测算法，WES 检测动态突变疾病和HLA/B/C 分型 16 种，WGS可检测动态突变疾病和HLA/B/C分型19 种。

智因云平台的智能分析算法和自动化报告管理系统等诸多领先技术，均已获得国家版权局计算机软件著作权登记证书。

五、临床与应用价值
智因东方构建 40 万人 WES/WGS 基因-表型遗传病大数据，提升遗传病阳性诊断率，智因东方深耕遗传病行业十余年，构建了全球最大的中国人种 WES/WGS 基因-表型数据库，其中患者数据 >20万，正常人数据 >20万，可提供真实世界证据，解决临床遗传病困扰的 VUS 问题，大幅提升遗传病诊断阳性率。智因东方结合遗传病大数据、人工智能技术和独家自研算法，自主研发智因AI大模型——“智因大脑”，可实现从原始数据到变异位点的自动分析和筛选，与人工筛选结果符合率超 99%，真正实现遗传病数据的“全自动”精准快速分析。智因AI大模型——“智因大脑”可为临床提供遗传病数据聚类和挖掘服务可助力数据挖掘和科研成果转化，是临床临床诊断和科研发现的好助手。自 2021年以来，智因东方已助力发现 18个人类新致病基因，为多个遗传病家庭明确了病因，也为多个遗传病的机制探究提供
了方向。

六、发展潜力
AI诊断大模型——“智因大脑”，让基因及变异致病性解读更可靠，智因大脑是一个基于真实世界的基因型-表型大数据，结合人工智能迭代算法而构建的可实现遗传病精准诊断及科研新发现的智能化知识体系。智因大脑目前集合了40万级智因Case、海量文献Case的基因型-表型结构化数据、百万级致病位点库，包括数十个人群频率库、基因疾病数据库、疾病表型库、三千多万篇文献等丰富的遗传知识图谱。同时，人工智能算法对Case证据和数十种特征向量进行迭代计算，可通过机器学习算法获得更精准的变异致病性评级，大幅提升对检测数据高效且准确的解读能力。
（1）40万级中国人WES/WGS基因型-表型大数据，助力遗传病精准诊断。智因大脑涵盖全球最大的中国人遗传病患者基因型-表型大数据（表1），并且对数据进行了高度结构化的管理，为每一位遗传病患者提供海量样本及变异对照信息。
（2）大数据人工智能迭代算法，提供可靠的“真实世界证据”。 智因大脑目前汇聚了4亿条变异、3400万篇文献和140万条位点文献证据，基于遵循ACMG/ClinGen SVI国际指南中的PS2新发、PM3反式、PS4富集、PP1共分离等证据，通过人工智能迭代算法，可对每一个基因及变异进行精准致病性判定。
（3）AI诊断大模型——“智因大脑”，轻松实现个性化基因/变异科研大发现。智因云平台集成科研聚类系统，帮助临和科研工作者轻松实现新的致病热点、新的致病基因、新的疾病表型等科研新发现。

七、行业潜力
1.期刊：《Acta Epileptologica》标题：SPOUT1 variants associated with autosomal recessive developmental and epileptic encephalopathy
2.期刊：《American Journal of Human Genetics》标题：Variants in EP400, encoding a chromatin remodeler, cause epilepsy with neurodevelopmental disorders
3.期刊：《BRAIN》标题：Heterozygous variants in USP25 cause genetic generalized epilepsy
4.期刊：《J Med Genet》标题：De novo variants in KCNJ3 are associated with earlyonset epilepsy
5.期刊：《Genes & Diseases》 标题：MPDZ variants associated with epilepsies and/or febrile seizures and the individualized genotype-phenotype correlation
6.期刊：《Frontiers in Molecular Neuroscience》
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