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《NBT》:何川/欧阳正清开发揭示细胞高阶RNA结构和RNA-RNA相互作用的新方法

2024-01-19 iNature 等1家媒体报道 科研进展

2024年1月18日,芝加哥大学何川及马萨诸塞大学欧阳正清共同通讯在Nature Biotechnology在线发表题为“KARR-seq reveals cellular higher-order RNA structures and RNA–RNA interactions”的研究论文,该研究提出了KARR-seq,它使用N3-酮醛标记和多功能化学交联剂来共价捕获和确定细胞内RNA-RNA相互作用和高阶RNA结构,独立于局部蛋白质与RNA的结合。该研究确定了呼吸道合胞病毒(RSV)和水疱性口炎病毒(VSV)的高阶RNA结构,并鉴定了病毒与宿主RNA之间的RNA-RNA相互作用,这种相互作用可能调节病毒的复制。