《Nature》子刊：常乘/贺福初团队与朱云平团队开发新的RT对齐算法和ID-free策略成功预测肝癌早晚复发

2023-12-12 iNature 等3家媒体报道 科研进展

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2023年12月11日，国家蛋白质科学中心（北京）常乘/贺福初团队与朱云平团队，在学术期刊Nature Communications（《自然－通讯》）在线发表题为DeepRTAlign: toward accurate retention time alignment for large cohort mass spectrometry data analysis（《DeepRTAlign：面向大队列质谱数据的保留时间精准对齐算法》）的论文。该研究发展了一种基于深度学习的保留时间对齐算法DeepRTAlign，可兼容所有能够提取三维特征（RT，m/z和intensity）的软件结果进行谱图特征对齐。本算法一方面可以作为传统分析流程的补充，降低多样本间定量结果的缺失值比例（效果优于MBR）；另一方面则可作为ID-free流程的主要步骤之一，不依赖鉴定结果即可对齐不同样本中的谱图特征。