《Nature》子刊：scBERT攻克单细胞测序数据分析痛点

2022-09-27 机器之心 等4家媒体报道 科研进展

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2022年9月27日，腾讯AI Lab姚建华等人在在《Nature》子刊《Nature Machine Intelligence》上发表了研究论文。该研究创新性地提出关于单细胞注释的scBERT算法模型，实现了高解释性、高泛化性、高稳定性的单细胞类型注释技术。这项研究成果对于单细胞转录组测序数据分析领域未来研究具有深远意义。该论文首次提出“基于大规模预训练语言模型的单细胞转录组细胞类型注释算法”，即“scBERT”模型，首次将“transformer”（自然语言处理算法经典计算单元）运用到单细胞转录组测序数据分析领域。该模型基于BERT范式，将细胞中基因的表达信息转化成可被计算机理解、学习的“语言”，并对细胞进行精准标注。