NatureDavid Baker开发原子级精度抗体从头设计新方法

2025-11-08 医药速览 等5家媒体报道 科研进展

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David Baker团队在Nature上发表了一项重要研究，开发出一种基于RFdiffusion生成式模型的计算流程，能够从头设计具有原子级精度的单域抗体（VHH）和单链抗体（scFv）。该方法通过微调RFdiffusion模型，使其适用于抗体设计，并利用抗体-抗原复合物结构数据进行训练。在设计过程中，框架区结构和序列作为固定条件输入，引导模型将设计自由度集中在互补决定区（CDR）环的构象生成上。同时，通过指定靶点上的“热点”残基，引导生成的CDR环与目标表位形成特异性相互作用。该流程不仅生成CDR环，还优化抗体相对于靶点的整体取向，有助于发现新颖的结合模式。实验验证表明，该计算流程能成功设计出针对流感血凝素、艰难梭菌毒素B、呼吸道合胞病毒表面蛋白及SARS-CoV-2病毒受体结合域的功能性抗体。这项技术为抗体药物研发提供了新的高效途径。（摘要由动脉网AI生成）