Nat Microbio：温州医科大学苏建忠团队开发单细胞水平遗传算法揭示宿主遗传-菌群-细胞类型内在关联性

2025-04-08 iNature 等4家媒体报道 科研进展

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温州医科大学苏建忠团队与华中科技大学陈卫华团队合作，开发了单细胞菌群多基因评分（scBPS）计算框架，首次系统性地绘制了肠道菌群与宿主细胞群体间的互作网络。该研究整合了荷兰微生物组计划的207个肠道微生物类群GWAS数据和“人类单细胞图谱”涵盖24个器官、253种细胞类型的转录组数据，揭示了关键菌属Collinsella通过调控中央静脉肝细胞胆固醇代谢影响宿主健康的分子机制。研究发现，肠道菌群与宿主组织存在模块化关联，如消化系统模块中的肝脏、胰腺、肠道等组织与特定菌群（如厚壁菌门和放线菌门）关联最强。在细胞层面上，中央静脉肝细胞显示出与菌群最显著的关联性，尤其是Collinsella。这项研究为解析复杂疾病的微生物组遗传机制提供了全新视角和直观工具。（摘要由动脉网AI生成）