《Nature Methods》：复旦大学马剑鹏团队在计算生物学取得突破，实现蛋白质结构冷冻电镜解析分辨率大幅提升

2023-10-11 iNature 等1家媒体报道 科研进展

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2023年10月9日，复旦大学马剑鹏团队（罗镇威为第一作者）在Nature Methods在线发表题为“OPUS-DSD: deep structural disentanglement for cryo-EM single-particle analysis”的研究论文，该研究描述了一种能够有效重建嵌入在冷冻电镜数据中的结构景观的算法，OPUS-DSD。OPUS-DSD使用三维卷积编码器-解码器架构，通过冷冻电镜图像训练，从而将结构变化编码到光滑且易于分析的低维空间中。可以遍历该空间以重建连续动态或聚类以识别不同的构象。通过对合成和真实冷冻电镜数据集的系统测试，证明了OPUS-DSD在解决结构非均匀性方面的性能，即使在较低的信噪比下也是如此。