2022年11月6日,和瑞基因于2022CSCO年会期间举办了“早晚兼顾,全程精准”专题卫星会,邀请山东省肿瘤医院于金明院士、上海交通大学附属胸科医院陆舜教授担任会议主席,并携手中国人民解放军总医院胡毅教授、四川大学华西医院卢铀教授、北京大学人民医院杨帆教授、华中科技大学同济医学院附属协和医院廖永德教授、重庆新桥医院朱波教授、华中科技大学同济医学院附属协和医院董晓荣教授、中国医学科学院肿瘤医院张凯教授、北京大学人民医院陈克终教授、复旦大学附属中山医院纪元教授,共同解析硬核科技如何助力癌症早筛、伴随诊断及复发监测的癌症全病程精准管理。
癌症已成为全球重要的健康问题,严重威胁人类的生命健康。对于癌症的诊治,于金明院士表示:“精准诊疗,检测先行。令人欣喜的是国内越来越多的检测公司都大力投入在科技创新探索的领域中,并高效推进相关临床转化。”陆舜教授表示:“正如本次会议的三大主题,科学抗癌,要对患者实行全病程管理,而在全病程的每个阶段,都将有越来越多的高新科技广泛的应用于临床、惠及至患者。”
如大会主席所讲,科技创新对癌症全病程精准管理而言至关重要。而本场会议也将围绕癌症早筛技术、MRD检测技术、DNA+RNA双重融合检测技术三大主题展开。
世界卫生组织已明确提出癌症的筛查和早诊早治是公认的癌症防控最有效的途径。在早期发现癌症并积极干预,不仅可以使患者获得更长的生存期甚至治愈,更能够显著地降低患者和社会的医疗经济负担。而现有癌症筛查方法往往存在灵敏度不足、可及性及便捷性差等局限。
由此,液体活检作为近年来的新兴技术,有望开启癌症早筛的新纪元。
张凯教授表示:“早期癌变液体活检信号的捕捉可以围绕碱基序列变异(突变)、碱基化学修饰(表观组)、片段组学特征(全基因组)三个方面来进行。这其中基于突变或表观组所开展的早筛检测,其灵敏度均较低,而以HIFI技术为代表的基于cfDNA全基因组的片段组学技术则被验证表明具有更高的灵敏度和特异性。”
HIFI是由和瑞基因原研的、可自我迭代的癌症早筛底层通用技术体系,目前可完成对拷贝数变异、核小体印记、片段大小分布、末端序列等多组学生物标志物检测。基于原研HIFI技术体系,和瑞基因联合国家肝癌科学中心、南方医科大学南方医院等18家三级甲等医院共同发起,国家肝癌科学中心主任王红阳院士及南方医科大学南方医院侯金林教授牵头,共同启动了“全国多中心、前瞻性肝癌极早期预警筛查项目”(PreCar)。
基于该项目,和瑞基因首先针对肝癌推出了全球首个经过万人前瞻性随访队列研究验证的临床级肝癌早筛产品“莱思宁®”,灵敏度可达95.42%,特异性可达97.91%,并被纳入首个《中国肝癌早筛策略专家共识》,被推荐作为肝癌早筛‘金字塔’模式中的重要技术手段。
随后,和瑞基因推出了一次性可筛查6大中国高危高发癌症(肺癌、食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结直肠癌)的多癌种早筛产品“全思宁™”,这是目前全球首个采用游离DNA(cfDNA)多维度全基因组测序(WGS)技术的多癌种早筛产品,拥有灵敏度87.58%、特异性99.09%、溯源准确性82%的国际领先性能。
“液体活检技术相比传统技术手段,不仅更灵敏、更早,且更无创便捷、更易普及。随着我国癌症防治政策和技术的共同发展,让我们有理由相信,以和瑞基因为代表的民族生物科技力量,将打造出更具特色的癌症早筛中国方案。”卢铀教授表示。
除技术革新之外,胡毅教授还表示:“肿瘤早筛早诊早治不只要技术‘早’突破,更要观念和应用‘早’普及。希望通过和瑞基因这样的优秀企业和我们医疗工作者的共同努力,可以在该领域有更多的作为及产出,以更多产品尽早服务于广大国人。”
MRD指根治性治疗后,传统影像学或实验室方法不能发现的微小/分子残留病灶,在肿瘤复发监测中的地位不容小觑,基于ctDNA进行MRD检测,可以及时监测肿瘤的复发及预后情况,尽早对患者进行进一步干预。而作为新兴标志物,目前MRD的检测仍存在诸多挑战,如:ctDNA入血比例低(ctDNA丰度低)、有的患者不能检出ctDNA、克隆性造血突变干扰等。
“为克服以上局限性,和瑞基因通过设参、扩容、增能、降噪、升频等多重维度提升MRD检测精准度。”陈克终教授分享到,“目前,基于Tumor-informed的个性化Panel和固定化Panel检测方法是目前国内MRD检测的主流。两种方法均有优劣。基于精准的检测技术,和瑞基因围绕这两种方法,与多家医院合作对肺癌MRD积极展开研究,为MRD技术发展提供更多参考。”
这些研究中,首要值得注意的是和瑞基因与北京大学人民医院王俊院士团队合作,于2019年发表的Dynamic研究。该成果发表于《Clinical Cancer Research》,一经发表后即被《Nature Reviews Clinical Oncology》列为亮点研究,是全球首个精准评估ctDNA围手术期动态变化的前瞻性研究,也是中国首个应用ctDNA监测肺癌术后MRD的研究。“Dynamic研究也充分证明了我们有能力领先全球树立国际标准。”杨帆教授表示。
此外,围绕新生抗原动态追踪难题,和瑞基因与重庆新桥医院朱波教授合作,采用WES+个性化Panel的方案对ctDNA进行动态监测,结果以封面文章于2020年发表在《Advanced Science》,是中国首个基于个性化Panel进行ctDNA动态监测的研究。
今年,和瑞基因再次与北京大学人民医院王俊院士团队合作,针对中国人群I期NSCLC的基因变异特征及术后复发分子机制展开进一步研究,成果发表于《Cell Reports》,为早期术后复发人群提供更多参考信息,基于tumor-informed的检测策略再次被证实具有临床可靠性。
目前,和瑞基因已于去年推出基于Tumor-informed固定panel的解决方案,该产品采用和全安-654大panel检测,包括3M检测区间,15000×测序深度,全面展示基因组特征信息,对于血液监测,优选纳入218个基因,充分考虑实体瘤靶向用药基因及高频突变,为肿瘤患者提供MRD精准检测策略。未来和瑞基因将进一步研发上市基于个性化定制MRD解决方案,个性化定制MRD将采用范围覆盖基因组全外显子区域、常见融合基因断点及热点基因非编码区域的WES检测作为基线数据,定制化设计血液监测panel,并添加补充模块,加入常见热点驱动突变,同时配合100000×超高深度测序,在准确监测微小病灶残留基础上进一步克服肿瘤异质性,打造个性化定制MRD优选方案。同时,也正如廖永德教授所讲:“和瑞基因也在持续探索MRD检测优化方案,通过多重技术探索,克服MRD检测挑战,助力MRD精准检测。”
基因融合发生于多种实体瘤,多基因融合检测已纳入指南及共识的常规推荐。随着越来越多的融合药物被获批用于临床且阳性患者靶向治疗预后好,目前临床对融合检测的关注度日益增加。
“虽然目前融合的检测方法和平台多样,但传统融合检测方法存在通量低、每次只检测一个基因等局限,对此NGS检测技术更具优势。”纪元教授表示,“DNA-based和RNA-based是通过NGS检测融合的两种检测方法,目前市场上大多采用DNA-based检测方法。虽然说采用NGS进行融合检测具有无可比拟的优势,但不可否认的是DNA-based的融合检测还存在一些挑战,如目标区域过大、DNA片段化、目标区域覆盖难度大、基因组变异复杂导致结果判读困难等,这都对DNA融合检测造成了一定困难。因此,NCCN指南也推荐DNA与RNA结合检测,相互补充,从而更大程度检出融合,避免漏检。”
“在众多技术手段中,DNA结合RNA双重检测可更有效检出融合基因,同时对检测要求也是更高的。”朱波教授表示,“和瑞基因进行了大量工作,使结构变异的检出率及准确性得到显著提高。”
为打造真正意义的双重检测,和瑞基因在DNA层面采用三重优化策略,增加探针覆盖范围及密度,提高检出率;优化捕获策略,提高重复区覆盖率;开发专利算法,兼容双重检测,来保障DNA层面的结构变异的精准检出。同时在RNA层面,和瑞基因采用专门针对高度降解FFPE RNA的专利capSmart技术,通过优化的RNA文库构建流程及特殊设计的探针池,克服RNA检测挑战,RNA检测成功率达94.7%。此外,和瑞基因采取DNA/RNA“一管双检”,一份样本同时进DNA/RNA共提,相较于双管双检模式,也更有效节约样本与时间。依托DNA+RNA双重检测技术,和瑞基因已携手多家医院鉴定出多种新型融合,助力患者获益于更有效的治疗方案,同时相关科研成果也已发表于多个国际权威期刊。
对此,董晓荣教授也表示:“单纯从DNA或RNA层面进行结构变异检测均存在局限性和挑战。对此,和瑞基因采用多重检测策略,打造了真正意义的双重检测,具有重要的临床意义。”
会议尾声,于金明院士对和瑞基因在肿瘤早筛、MRD检测和DNA+RNA双重融合检测等领域进行的大量创新探索表示了高度认可,也期待着越来越多的高新科技产品能更好地为健康中国服务、更好地为全人类的健康服务。陆舜教授表示通过本次会议,对和瑞基因在癌症精准医疗方面做出的努力及贡献有了更深入的认知,期待和瑞基因凭借前瞻性的产品设计和精益求精的产品性能,为我国抗癌事业带来更多科学策略和手段。