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一、需求描述
希望通过与新药发现企业或者研究机构进行合作,提供CRO服务;针对已发现的新靶点可以进行转让或者联合开发推向临床前研究,有意者欢迎沟通。
二、项目概况
易及性共价分子库及新药物靶点发现
1、简介
本项目采用含有各种亲电弹头的化学合成模块,基于含氮活泼中间体化学(胺基叶立德、三氮唑自由基等),解决它们与亲电弹头的兼容性问题,发展其多组分反应从简单模块快速一锅构建季碳中心合成立体多样性共价分子(图1),开发系列室温下空气中操作便捷、反应快速的一锅合成方法学,为新靶点发现提供了高质量、易及性实体分子库,且基于库分子结构特色开了一种高效免标记蛋白质组学策略快速鉴定靶点。

本项目开发易及性建库策略构建立体多样性共价分子库,以期提高新靶点发现几率,具有以下建库优势:
1)采用多模块一锅法合成法构建库分子结构新颖性,步骤少,建库效率高;通过模块调控实现分子结构多样性和建库规模化;
2)含氮化合物具有广泛生物活性,基于含氮活泼中间体化学开发一锅合成方法学构建库分子,能有效提升随机筛选发现潜在活性分子的几率,且反应时间短;
3)通过多模块一步构建全取代季碳中心,不仅能快速合成球形分子,也可通过立体化学控制提供易得的异构体,还可通过全取代基团衍生预留可修饰化学位点,为后续靶点蛋白亲和富集奠定化学基础;
4)引入亲电共价弹头不仅实现活性分子与靶蛋白间高亲和作用,还可免除额外蛋白标记流程;
5)开发室温下空气中兼容的催化剂和试剂实现建库操作便捷,分子库具有易及性。
本项目采用我们原创构建的立体多样性共价分子库进行筛选所发现的系列活性工具分子,以该系列活性分子为基础,基于前期精心设计的库分子结构特征,可免除蛋白标记流程、同位素标记流程,且具有可修饰化学位点而不影响生物活性的特色,开发了一类免标记的基于活性蛋白质组学策略(CSM-ABPP),通过相对定量分析可以快速鉴定潜在靶点(图2)。

基于源头活性分子库的设计与高效构建,解决了新靶点发现几率和效率问题两个关键问题,再结合原创性活性工具分子与临床病人组织真实样本、人工智能技术,对新靶点进行验证基础上进行抗肿瘤候选药物分子发现研究(图3),为目前临床无靶向的恶性肿瘤开发原创性靶点。

2、技术优势
1)结构新颖—钓取新靶点;
2)亲电弹头与靶蛋白共价连接—无需额外蛋白标记可提高亲和富集效率;
3)全取代季碳中心有望提供活性药效团之外可修饰位点而不影响分子活性,实现靶蛋白有效亲和富集;
4)季碳中心的立体化学可提高活性分子选择性,减少脱靶效应和非特异性吸附;
5)异构体易得可用于相对定量研究,免除质谱鉴定中繁琐昂贵同位素标记流程,避免海量蛋白质谱数据分析,快速锁定靶点,为新靶点发现提供一种高效免标记蛋白组学新策略;
6)库分子易及性能够便捷地规模化制备或获得众多数量实体分子以供筛选;且易于修饰能为后续靶点发现与验证奠定化学基础。
3、应用领域
- 采用原创的高选择性活性共价工具分子,结合我们自己所发展的无需标记的基于活性蛋白质组学策略,高效发现潜在药物靶点。主要针对临床未满足需求的肿瘤主要是罕见肿瘤进行原创性药物发现:
1)新靶点发现:针对各类新药研发机构或企业,提供CRO服务,快速发现新靶点,也可针对我们独立发现的靶点进行转让,也可进行联合开发,主要针对肿瘤靶向治疗;2)新结构发现:以活性分子为起点化合物,开发抗肿瘤药物分子;
3)生物标志物发现:目前肿瘤靶向治疗主要是依据分子分型进行诊断,所发现的新靶点也可针对其他临床未满足需求的肿瘤适应症治疗和靶向药物开发。
- 此外,根据现有多样性共价分子库,结合蛋白质组学分析技术发展罕见肿瘤生物标志物或者用于虚拟筛选模型开发软件等。
4、知识产权情况
1)授权专利:
发明专利201910550556.0;发明专利201910108540.4;
发明专利201810175239.0;发明专利201810309428.2;
发明专利201710079316.8;发明专利201710004520.3.
2)已申请专利:
发明专利 202111422968.X; 发明专利 202111347644.4;
发明专利 202010972702.1; 发明专利 202010971435.6;
发明专利 201911258159.2; 发明专利 201911259277.5;
发明专利 201810309428.2; 发明专利 201911020897.3;
发明专利 201710092353.2; 发明专利 201810091809.8;
发明专利 201610902757.9; 发明专利 201810548769.5.
以上专利均归属华东师范大学。
5、商业化前景
1)预估市场竞争因素
由于现阶段罕见肿瘤治疗的手段依旧是化疗药,近年来,并没有得到更好的改善,以及预后问题。市场上也没有有效的成药性靶点。因此,通过构建结构多样的化合物库发现潜在的靶点在竞争中展现出明显优势,未来还可以开发新药。罗氏、辉瑞、诺华等国际大生物医药公司高达三分之一管线在新靶点药物发现方面。此外,截止到2023年12月底,上海拥有生物医药产业领域相关企业3224家、苏州工业园区生物医药企业2300多家,采用我们的技术发现新靶点将会具有潜在的广泛市场和客服。
与人工智能相比较,我们的技术具有自有知识产权的分子库和实体分子,还为后续药物开发提供了一个起始化合物;与其他ABPP技术相比,我们的技术不需要蛋白标记流程和同位素标记流程,将大大提升蛋白富集的效率;想用相对定量快速锁定潜在靶点,将大大缩短新靶点发现周期。而且,化合物库规模还可以通过自有合成方法快速扩建。
2)技术可行性
建库技术非常成熟,部分相关工作于2016年获得上海市自然科学一等奖,目前已在包括Science子刊等发表科研论文78篇,申请中国发明专利36项,已获授权16项。目前化合物库的规模在5000个实体分子(每个化合物结构不同,且包含其相应结构表征数据),规模仍在继续扩大。
3)市场规模预估
我们结构多样性化学遗传学库具有高亲和性、高选择性和易于化学修饰及异构体可及性等独特性。根据相关机构统计,2019-2025 年间,以年复合成长率7%成长,至2025年,医药市场规模将达 1.8万亿美元。100个分子(10 mmol/100 μL)市场价预估为30万。现化合物库已有化合物约5000个结构不同分子,仍在继续扩大,化学遗传学分子库总市场预估约千亿美元。
4)经济社会效益分析
基于正向化学遗传学的药物筛选,化合物库是药物筛选与发现的物质基础,也是创新的源头。目前,国内科学家主要采用自然来源的分子库包括microRNA、核酸适配体和天然产物等作为重要工具构建筛选的分子库而发现活性工具分子,利用非天然小分子化学库作为筛选平台进行化学遗传学研究则非常有限。这与缺少高筛选效率的特色小分子化学遗传学库有关。国外特别是欧美制药大国,除上述自然来源库外,则主要由于跨国制药公司几十年甚至长达百年的积累而发展了系列有特色的非天然小分子化学库用于化学遗传学筛选。
我国目前在此方面,还没有具有类似特色的共价键抑制剂遗传学化学库用于商业化。如果能在我们自有的源头创新性合成技术的基础上,构建我们特色的、自有知识产权的化合物库并实现商业化,一方面填补我国在此领域的短板,另外一方面,必将促进我国在原创性新靶点及新药物作用机制发现方面的研究与社会服务,助力提升我国在源头创新的药物发现中的影响力。
6、成功案例/产品
构建了特色共价分子库,对化合物库进行探究,发现对多种肿瘤有纳摩尔级的抑制活性,比如胃癌、肺癌、结肠癌和骨肉瘤等,其中在骨肉瘤SJSA-1细胞系中,发现并初步验证了PDIA4作为治疗骨肉瘤的潜在靶点, 在骨肉瘤MNNG-HOS细胞系中,发现并初步验证了DDX5作为治疗骨肉瘤的潜在靶点。在骨肉瘤143B细胞系中,发现并初步验证了NOGO-B作为治疗骨肉瘤的潜在靶点。同时,我们从活性工具分子出发,还发现了三个系列后续药物活性分子。

华东师范大学
华东师范大学是由国家举办、教育部主管,教育部与上海市人民政府重点共建的综合性研究型大学。学校成立于1951年10月16日,是以大夏大学(1924年)、光华大学(1925年)为基础,同时调进圣约翰大学、复旦大学、同济大学和浙江大学等高校的部分系科,在大夏大学原址上创办的。1959年学校被中共中央确定为全国16所重点院校之一。1972年学校与上海师范学院、上海体育学院等院校合并,改名上海师范大学。1978年学校再次被确认为全国重点大学。1980年学校恢复华东师范大学校名。1986年学校被国务院批准成为设立研究生院的33所高等院校之一。1996年被列入"211工程"国家重点建设大学行列。1997-1998年,上海幼儿师范高等专科学校、上海教育学院和上海第二教育学院等先后并入。2002年根据上海市高校布局结构调整的战略部署,学校启动闵行校区规划建设,并于2006年主体搬迁到闵行校区,形成了“一校两区、联动发展”的办学格局。2006年教育部和上海市决定重点共建华东师范大学,学校进入国家“985工程”高校行列。2017年学校进入国家世界一流大学建设高校A类行列,全面开启扎根中国大地建设一流大学的新征程。 立德树人,攀高行远。作为新中国组建的第一所社会主义师范大学,学校始终秉承“智慧的创获,品性的陶熔,民族和社会的发展”这一崇高大学理想,恪守“求实创造,为人师表”的校训精神,全面深入贯彻党的教育方针和各项决策部署,落实立德树人根本任务,为党育人、为国育才,按照学校第十三次党代会精神和《“十三五”发展规划纲要》《世界一流大学建设方案》确定的建设目标路径,围绕“育人、文明、发展”责任使命,持续加强全面从严治党,推进全员全过程全方位育人,重点实施教育教学创新引领、学科科研优化提升、国家战略精准对接工程,聚焦“教育+”“生态+”“健康+”“智能+”“国际+”五大行动计划,分三步实现一流办学目标:到2020年建成特色鲜明、优势突出的世界知名高水平大学,到2035年接近世界一流大学水平,到本世纪中叶建成世界一流大学,为实现“建教育强国”和“以教育强国”的光荣事业,为中华民族伟大复兴作出新的更大贡献! 学校目前设有4个学部:地球科学学部、教育学部、经济与管理学部、信息学部;30个全日制学院:人文社会科学学院(中国语言文学系、历史学系、哲学系、政治学系)、外语学院、传播学院、国际汉语文化学院、教师教育学院、心理与认知科学学院、体育与健康学院、马克思主义学院、社会发展学院、法学院、经济学院、工商管理学院、公共管理学院、统计学院、亚欧商学院、数学科学学院、物理与电子科学学院、化学与分子工程学院、生命科学学院、地理科学学院、城市与区域科学学院、生态与环境科学学院、海洋科学学院、计算机科学与技术学院、软件工程学院、数据科学与工程学院、通信与电子工程学院、音乐学院、美术学院、设计学院;4个书院:孟宪承书院、经管书院、大夏书院、光华书院;3个实体教学科研研究院:思勉人文高等研究院、国际关系与地区发展研究院、河口海岸科学研究院;12个校管科研平台机构(含2个国家重点实验室):河口海岸学国家重点实验室、精密光谱科学与技术国家重点实验室、国家教育宏观政策研究院、上海终身教育研究院、崇明生态研究院、城市发展研究院、 “智能+”研究院、转化科学与技术联合研究院、脑科学与教育创新研究院、医学与健康研究院、社会主义历史与文献研究院、上海智能教育研究院;2个管理型学院:开放教育学院/上海教师发展学院、创新创业学院。另有设在学校的教育部中学校长培训中心。 截至2021年3月,学校有博士学位授权一级学科30个,硕士学位授权一级学科35个,可授予21种硕士专业学位,以及教育博士专业学位,有26个博士后科研流动站,85个本科专业。拥有教育学、地理学2个国家一级重点学科,5个国家二级重点学科、5个国家重点培育学科,12个教育部第四轮学科评估A类学科,6个上海市高峰学科(I类2个,II类2个,IV类2个),12个上海市重点学科和17个上海市一流学科(A类4个,B类13个)。学校有教职工4,422人,其中专任教师2,379人。教授及其他高级职称教师2,081人,其中含中国科学院和中国工程院院士(含双聘院士)18人,国家及上海市其他各类人才计划入选者288人。在校全日制本科生15,543人;在校博士研究生3,334人,硕士研究生15,239人;在校留学生(学历生)1,355人。学校主要校区为闵行校区(地址为上海市东川路500号)和中山北路校区(地址为上海市中山北路3663号),校园占地总面积约207公顷。 学校理工科拥有2个国家重点实验室,1个国家工程技术研究中心,1个国家野外科学观测研究站,1个国家级国际联合研究中心,7个教育部重点实验室和工程研究中心,1个教育部国际合作联合实验室,1个教育部战略研究基地和高等学校软科学研究基地,1个教育部野外科学观测研究站,1个民政部研究中心,1个国家新闻出版署重点实验室,1个自然资源部工程技术创新中心,12个上海市重点实验室和工程技术研究中心,1个上海市工程研究中心,1个上海市野外科学观测研究站,1个上海市软科学研究基地,1个上海市协同创新中心;学校文科拥有6个教育部人文社会科学重点研究基地,1个国家教材建设重点研究基地,1个全国普通高校中华优秀传统文化传承基地,1个中国老龄协会老龄科研基地,7个上海市哲学社会科学创新研究基地,7个上海市人民政府决策咨询研究基地工作室,4个上海高校智库,10个上海高校“立德树人”人文社会科学重点研究基地,7个国别和区域研究中心获教育部备案。现有国家文理科基础学科人才培养和科学研究基地6个,基础学科拔尖学生培养计划2.0基地6个,国家级实验教学示范中心2个,国家级虚拟仿真实验教学中心1个,上海市实验教学示范中心9个。学校主办、承办和合办各类中文期刊23种、英文期刊6种,两校区图书馆馆藏印刷型文献总量486.67万余册、各类电子文献数据库161个(462个子库)。学校成立教育集团,现有自办与合作举办的附属中小学、幼儿园共51所(正式招生办学)。学校继续教育坚持管办分离,积极落实国家指令性计划项目,培育高品质非学历教育项目,研发校本研修网络平台。 学校注重国际合作交流,先后与里昂高师等法国三所高等师范学院、美国纽约大学、弗吉尼亚大学、加拿大不列颠哥伦比亚大学、澳大利亚昆士兰大学、日本东京大学等世界著名大学建立了紧密合作关系,与世界300余所高校和科研机构签订了学术合作与交流协议。与里昂高师等法国三所高等师范学院成立中法联合研究生院;与法国里昂高师和法国国家科学研究中心成立中法社会与科学联合研究院;与美国纽约大学联合创办的上海纽约大学,是第一所具有独立法人资格的中美合作创办的大学;与法国里昂商学院合作共建亚欧商学院;与以色列海法大学合作共建转化科学与技术联合研究院;与加拿大阿尔伯塔大学共建先进科学与技术联合研究院。学校设有国际汉语教师研修基地,作为中方合作院校建设4所孔子学院和2所独立孔子课堂。

华东师范大学
华东师范大学是由国家举办、教育部主管,教育部与上海市人民政府重点共建的综合性研究型大学。学校成立于1951年10月16日,是以大夏大学(1924年)、光华大学(1925年)为基础,同时调进圣约翰大学、复旦大学、同济大学和浙江大学等高校的部分系科,在大夏大学原址上创办的。1959年学校被中共中央确定为全国16所重点院校之一。1972年学校与上海师范学院、上海体育学院等院校合并,改名上海师范大学。1978年学校再次被确认为全国重点大学。1980年学校恢复华东师范大学校名。1986年学校被国务院批准成为设立研究生院的33所高等院校之一。1996年被列入"211工程"国家重点建设大学行列。1997-1998年,上海幼儿师范高等专科学校、上海教育学院和上海第二教育学院等先后并入。2002年根据上海市高校布局结构调整的战略部署,学校启动闵行校区规划建设,并于2006年主体搬迁到闵行校区,形成了“一校两区、联动发展”的办学格局。2006年教育部和上海市决定重点共建华东师范大学,学校进入国家“985工程”高校行列。2017年学校进入国家世界一流大学建设高校A类行列,全面开启扎根中国大地建设一流大学的新征程。 立德树人,攀高行远。作为新中国组建的第一所社会主义师范大学,学校始终秉承“智慧的创获,品性的陶熔,民族和社会的发展”这一崇高大学理想,恪守“求实创造,为人师表”的校训精神,全面深入贯彻党的教育方针和各项决策部署,落实立德树人根本任务,为党育人、为国育才,按照学校第十三次党代会精神和《“十三五”发展规划纲要》《世界一流大学建设方案》确定的建设目标路径,围绕“育人、文明、发展”责任使命,持续加强全面从严治党,推进全员全过程全方位育人,重点实施教育教学创新引领、学科科研优化提升、国家战略精准对接工程,聚焦“教育+”“生态+”“健康+”“智能+”“国际+”五大行动计划,分三步实现一流办学目标:到2020年建成特色鲜明、优势突出的世界知名高水平大学,到2035年接近世界一流大学水平,到本世纪中叶建成世界一流大学,为实现“建教育强国”和“以教育强国”的光荣事业,为中华民族伟大复兴作出新的更大贡献! 学校目前设有4个学部:地球科学学部、教育学部、经济与管理学部、信息学部;30个全日制学院:人文社会科学学院(中国语言文学系、历史学系、哲学系、政治学系)、外语学院、传播学院、国际汉语文化学院、教师教育学院、心理与认知科学学院、体育与健康学院、马克思主义学院、社会发展学院、法学院、经济学院、工商管理学院、公共管理学院、统计学院、亚欧商学院、数学科学学院、物理与电子科学学院、化学与分子工程学院、生命科学学院、地理科学学院、城市与区域科学学院、生态与环境科学学院、海洋科学学院、计算机科学与技术学院、软件工程学院、数据科学与工程学院、通信与电子工程学院、音乐学院、美术学院、设计学院;4个书院:孟宪承书院、经管书院、大夏书院、光华书院;3个实体教学科研研究院:思勉人文高等研究院、国际关系与地区发展研究院、河口海岸科学研究院;12个校管科研平台机构(含2个国家重点实验室):河口海岸学国家重点实验室、精密光谱科学与技术国家重点实验室、国家教育宏观政策研究院、上海终身教育研究院、崇明生态研究院、城市发展研究院、 “智能+”研究院、转化科学与技术联合研究院、脑科学与教育创新研究院、医学与健康研究院、社会主义历史与文献研究院、上海智能教育研究院;2个管理型学院:开放教育学院/上海教师发展学院、创新创业学院。另有设在学校的教育部中学校长培训中心。 截至2021年3月,学校有博士学位授权一级学科30个,硕士学位授权一级学科35个,可授予21种硕士专业学位,以及教育博士专业学位,有26个博士后科研流动站,85个本科专业。拥有教育学、地理学2个国家一级重点学科,5个国家二级重点学科、5个国家重点培育学科,12个教育部第四轮学科评估A类学科,6个上海市高峰学科(I类2个,II类2个,IV类2个),12个上海市重点学科和17个上海市一流学科(A类4个,B类13个)。学校有教职工4,422人,其中专任教师2,379人。教授及其他高级职称教师2,081人,其中含中国科学院和中国工程院院士(含双聘院士)18人,国家及上海市其他各类人才计划入选者288人。在校全日制本科生15,543人;在校博士研究生3,334人,硕士研究生15,239人;在校留学生(学历生)1,355人。学校主要校区为闵行校区(地址为上海市东川路500号)和中山北路校区(地址为上海市中山北路3663号),校园占地总面积约207公顷。 学校理工科拥有2个国家重点实验室,1个国家工程技术研究中心,1个国家野外科学观测研究站,1个国家级国际联合研究中心,7个教育部重点实验室和工程研究中心,1个教育部国际合作联合实验室,1个教育部战略研究基地和高等学校软科学研究基地,1个教育部野外科学观测研究站,1个民政部研究中心,1个国家新闻出版署重点实验室,1个自然资源部工程技术创新中心,12个上海市重点实验室和工程技术研究中心,1个上海市工程研究中心,1个上海市野外科学观测研究站,1个上海市软科学研究基地,1个上海市协同创新中心;学校文科拥有6个教育部人文社会科学重点研究基地,1个国家教材建设重点研究基地,1个全国普通高校中华优秀传统文化传承基地,1个中国老龄协会老龄科研基地,7个上海市哲学社会科学创新研究基地,7个上海市人民政府决策咨询研究基地工作室,4个上海高校智库,10个上海高校“立德树人”人文社会科学重点研究基地,7个国别和区域研究中心获教育部备案。现有国家文理科基础学科人才培养和科学研究基地6个,基础学科拔尖学生培养计划2.0基地6个,国家级实验教学示范中心2个,国家级虚拟仿真实验教学中心1个,上海市实验教学示范中心9个。学校主办、承办和合办各类中文期刊23种、英文期刊6种,两校区图书馆馆藏印刷型文献总量486.67万余册、各类电子文献数据库161个(462个子库)。学校成立教育集团,现有自办与合作举办的附属中小学、幼儿园共51所(正式招生办学)。学校继续教育坚持管办分离,积极落实国家指令性计划项目,培育高品质非学历教育项目,研发校本研修网络平台。 学校注重国际合作交流,先后与里昂高师等法国三所高等师范学院、美国纽约大学、弗吉尼亚大学、加拿大不列颠哥伦比亚大学、澳大利亚昆士兰大学、日本东京大学等世界著名大学建立了紧密合作关系,与世界300余所高校和科研机构签订了学术合作与交流协议。与里昂高师等法国三所高等师范学院成立中法联合研究生院;与法国里昂高师和法国国家科学研究中心成立中法社会与科学联合研究院;与美国纽约大学联合创办的上海纽约大学,是第一所具有独立法人资格的中美合作创办的大学;与法国里昂商学院合作共建亚欧商学院;与以色列海法大学合作共建转化科学与技术联合研究院;与加拿大阿尔伯塔大学共建先进科学与技术联合研究院。学校设有国际汉语教师研修基地,作为中方合作院校建设4所孔子学院和2所独立孔子课堂。

