药物设计成功率稳定在20%以上，英飞智药如何助推AI制药落地？

从2020年中国AI制药爆发元年算起，历经三年，人类不仅见证了AI速度，也在不断进化AI。

英飞智药创始人裴剑锋博士向橙果局介绍公司最近更新的平台PharmaMind V3.8。值得关注的是，在PharmaMind V3.8版本中，该平台成功集成了一款由英飞智药与北京大学共同研发的药物设计版ChatGPT工具——“PharmGPT”，是中国医药领域首个GPT系统。

 图为PharmGPT,受访者供图

而与其他AI制药企业最大不同是，英飞智药以PharmaMind V3.8平台为依托，将药物研发成功率稳定在20%以上。“这种成功率是全世界领先的，也是英飞智药最核心、最自豪的地方。”裴剑锋说到。

英飞智药在2019年6月正式开始运营。也是在这两年，中国迎来了科学家和硬科技的创业浪潮。

一方面，由于国家的政策引导与扶持，科学家创业宏观环境利好；另一面，移动互联网时代流量红利消失，原有模式创新带来的增长捉襟见肘，在产业转型升级的背景下，人们看到了科技产业，尤其是生命科技领域的机会。

“中国的基础科研正在赶超世界最先进的水平，但在应用落地层面离世界最先进的水平还有较大的差距。我也意识到只有将创新技术实现真正的落地，才能为社会实现更大的价值。鉴于这样的思考，我觉得我们多年的研究成果和创新技术比较适合去做这样的转化和落地。”裴剑锋表示。

凭借着超25年“CADD+ AIDD”技术积累，这支国内最早一批从事“AI+药物设计交叉”的研发团队，向市场给出了自己的解决方案，也为英飞智药赋予了更多意义。

“英飞智药”，英文翻译为Infinite，意为“无穷无尽”，同样也寄托着团队通过AI平台来源源不断产生创新药物的希望。为了实现这样的期望，其中的关键就在于实现AI制药的落地。

“尽管AI制药技术已取得显著进展，但整体还没有达到真正可信的应用层面。自英飞智药成立的第一天起，团队就致力于AI制药的系统性落地，专注于发展应用于真实世界的药物设计技术——目的就是提高AI制药成功率到稳定且实用化的水平。”裴剑锋说到。

随着DeepMind团队的AlphaFold2在蛋白质折叠上取得重大突破，AI在制药行业有了造神的可能。尽管神话尚在成长，但资本市场已经将其捧上神坛，算法和算力受到资本的激烈追捧，忽视了AI制药如何落地的根本性问题。因此，当资本的泡沫有了出清的迹象，AI制药也到了自证技术实力的过渡期。作为创新药的命运共同体，AI验证技术硬不硬，研发结果成为最有力的回答。

从2020年10月PharmaMind V1.0和V2.0内测版完成后，英飞智药开始布局自研和合作新药管线。截至目前，英飞智药开展的大部分都是First-in-Class药物管线，进展最快的管线在动物试验中已有不错成果，正在推向候选药。

在裴剑锋看来，创新药研发是一个非常复杂的过程，很多人认为AI制药就是如何将AI应用于新药研发，但是其实学科的交叉融合会产生大量新的科学问题和技术难题，如何解决这些硬核问题才是AI制药落地的关键，AI制药平台必须能稳定输出达到预期实验结果分子结构。

通过3年多的努力，无论是在对现有的药物数据的统计结果上，还是在管线研发的实践意义上，英飞智药都做到平均每设计5个分子，就获得1个高活性、高成药性分子，成功率达到20%，这非常有助于AI制药的落地。

此外，在AI虚拟筛选的富集率（EF1%）上，英飞智药的实际筛选富集率经常达到100或者以上，远超业界10-20的一般水平。

2023年2月，在发展的第4个年头，英飞智药将PharmaMind更新到V3.8版本，并发布了最新工具模块PharmGPT。这是一类受粗粒化药效团限制的GPT分子生成模型。

为了进一步提高药物研发的成功率，PharmGPT结合百万活性化合物小分子与其药效团的对应关系进行自回归学习，使研究人员可以探索药效团一致、结构新颖的具有合成空间的全新化合物。

同时，PharmGPT还能够重现了多个现有临床药物分子的结构优化过程，利用AI设计工具来帮助研究人员进行回顾性的分子设计和评价，从而充分展现分子设计的效能。

目前，英飞智药已经使用基于靶标结构的分子生成方法MolBuilder模块和PharmGPT模块，在内部的多个管线项目中进行了前瞻性式的应用，并获得了一系列较高活性的首创化合物结构。

“回顾英飞智药的研发管线，我们发现其中最多的只设计测试了72个分子即达到了主要设计终点，而一般的管线往往只需设计测试50个左右的分子即可达到设计目标。”裴剑锋说到。

AI辅助药物设计已经开启一个新的时代，它肯定能够让药物的研发更快，成本更低，效率更高。从AlphaFold2再到ChatGPT横空出世, 人们在感受AI技术发展带来震撼的同时，也在接受AI真的能帮助药物研发这件事。

2023年，英飞智药开始建立BD(商务拓展)团队。“之前我们觉得如果基础打得不够牢靠，就不能成为一家真正的AI制药企业。”裴剑锋这样认为。从企业发展的角度来看，从2019年到2022年，英飞智药团队始终在完善更新PharmaMind平台。

“现在我们平台的设计成功率已经远超我们在学术研究时的水平，达到了世界领先水平，并初步实现工业化落地的目标。”裴剑锋说。

接下来，英飞智药的工作重点将是进一步推动AI制药的落地。一方面，正式组建商务团队，主动寻找合作机会，为医药工业赋能真正的价值；另一方面，加速代表性自研管线进度，证明其AI技术优势。

不仅如此，英飞智药还在招募国际化人才，为中国的AI制药品牌扬帆出海做铺垫。