被科学家杂志评为顶级创新，MD安德森癌症中心也用它的蛋白质组学产品

单细胞领域正在以惊人的速度发展。

根据Precedence Research报道，全球单细胞分析市场规模预计将从2022年的48.7亿美元增至2030年的185.9亿美元左右，复合年增长率为18.22%。

其迅速增长的趋势，吸引了大批生命科学从业者的关注。研究人员可以通过分析单个细胞的基因表达、蛋白质组成等信息，揭示不同细胞之间的差异和相互作用，从而了解疾病的发生机制、药物开发等方面的问题。

IsoPlexis便是研究细胞功能表征的参与者之一。

IsoPlexis成立于2013年，总部位于美国康涅狄格州，致力于开发识别患者免疫反应的单细胞检测系统，通过揭示小细胞亚群中独特的免疫生物标志物，将免疫疗法和靶向疗法推进到更高精度和个性化的阶段。

成立近10年来，IsoPlexis已在12轮融资中获得了2亿美元的融资额，并于2021年10月在纳斯达克上市，股票代码为“ISO”。此前，IsoPlexis被The Scientist、Fierce、BIG Innovation、红点等多家机构评为顶级创新或设计。

IsoPlexis所得荣誉

10年终上市，似乎IsoPlexis熬到了出头之日。然而，2023年3月，IsoPlexis被Berkeley Lights（Nasdaq：BLI）收购，退出纳斯达克市场。两家公司合并为PhenomeX（Nasdaq：CELL），成为一家功能细胞生物学企业，为行业提供活细胞生物学研究工具。

上市、退市、并购是生命科学公司发展的常态。曾被冠以“顶级创新”称号的IsoPlexis，做出这一决定，是无奈之举还是战略使然？

为什么检测细胞因子如此重要？

每个免疫细胞都是不同的，而细胞因子功能决定了每个细胞对肿瘤的反应。例如CD4+T细胞可以协调其余细胞攻击肿瘤，CD8+T细胞和NK细胞则能够将有效负载传递至肿瘤。因此，知晓每个细胞的完整特征至关重要。

传统的细胞检测方法主要分析来自一群细胞的平均反应，而不考虑单个细胞的表型。通过其蛋白质组的新技术，IsoPlexis能够从复杂样品中研究单个细胞，直接检测重要的功能性细胞因子。值得一提的是，IsoPlexis将细胞检测及分析集成在一个系统上，用CodePlex系列芯片、Isospark/ IsoLight仪器、IsoSpeak软件为生命科学从业者提供了一套完整的解决方案。

 IsoPlexis检测全流程

首先，IsoPlexis利用Isocode芯片，在芯片中以高度敏感和特定的方式，对每个细胞高度多重化的抗体，进行条形码编码。Isocode以自动化的方式，捕获多重大量细胞因子指标的关键测量值。每个Isocode芯片均带有蛋白质组条形码，可定量读出每个细胞的32种细胞因子，而整个过程只需5分钟。

 Isocode芯片

第二步则是上机。传统的ELISA（酶联免疫吸附试验）通常包含涂覆固相酶标板、样本加入、洗涤等10余步工作流程，需要耗费实验室技术人员20多个小时。

IsoPlexis旗下的Isospark/IsoLight仪器提供了一个自动化的工作流程。研究人员只需将样品移入芯片，再将芯片放入系统中，选择想要运行的检测即可。研究人员也无需执行标准曲线连续稀释，整个流程只包含5——20分钟的动手时间。

Isospark以及IsoLight仪器

最后，技术人员可使用IsoSpeak软件进行自动化现场分析和功能性单细胞绘图。IsoSpeak利用t-SNE（t分布式随机邻居嵌入）功能，通过细胞因子最大的功能差异来区分细胞，从而绘制细胞图。与此同时，t-SNE功能利用可视化响应者与非响应者的分层差异，来揭示反映细胞生物标志物的功能来源。

在操作过程中，技术人员只需单击按钮便可可视化、分析和导出数据。

在为客户提供实验的工程中，IsoPlexis收集到了各种超强免疫和肿瘤细胞类型。

在销售仪器和提供服务外，IsoPlexis在思考，它还能做什么？

现任CEO Sean Mackay在一次采访中透露道：“我们从为客户运行的服务中获得了大量数据。我们认为，如果发布，这些数据可以推动更多增长。这对我们来说是一个权衡，也是一个艰难的决定。我们最终相信，我们的高度多重功能蛋白质组数据是独一无二的，当人们发表文章时，他们将使用我们的分析来生成更多数据。”

因此，IsoPlexis开发了一个以功能蛋白质组学为特征的功能细胞库（FCL），用来补充基于基因组的人类细胞图谱。

简单地说，这个综合库包括T 细胞、自然杀伤细胞、单核细胞、针对血液和实体瘤的CAR-T 细胞、TCR-T细胞、黑色素瘤细胞、HeLa细胞和其他免疫细胞。基于IsoPlexis的单细胞功能蛋白质组学技术，FCL定义了每个细胞的功能表型。

功能细胞库

此外，该细胞库也被命名为“超人细胞库”，IsoPlexis将高度多功能的细胞比喻为“超人类细胞”，它们是免疫反应的早期参与者和协调者。这些罕见的高功能细胞亚群可能是有益的（超级英雄细胞），也可能是有害的（超级恶棍细胞）。

其中，超级英雄细胞是高度多功能的“超级细胞”的罕见亚群，它们协调针对肿瘤的反应，并与效力、持久性和生存相关。超级恶棍细胞是高度多功能的“超级细胞”，可驱动疾病进展，并与炎症、毒性和抵抗力相关。而检测这些细胞对于开发更有效的免疫疗法和疫苗至关重要。

该库充当研究工具，带有带注释的细胞类型列表，为行业研究者提供了一座桥梁。研究人员可访问功能细胞库，滚动浏览并搜索，利用功能表型数据来了解患者体内的反应，进而推动技术转化和临床应用。

新冠疫情之初，IsoPlexis在行业内大放异彩。

2020年3月，IsoPlexis与系统生物学研究所（ISB）建立合作伙伴关系。ISB利用IsoPlexis技术，绘制单细胞水平的功能性免疫反应图，对已诊断出患有或已康复的新冠患者的免疫细胞进行研究。在此期间，IsoPlexis还与哥伦比亚大学医学系传染病科达成合作，IsoPlexis的解决方案，同样被用于研究COVID-19。

IBS所长James Heath 表示：“使用IsoPlexis系统对每个免疫细胞进行功能表型分析，将成为了解受影响患者免疫反应的基石。”

与此同时，IsoPlexis一度成为国际期刊的常驻客，研究人员使用其技术发布的文献近百篇。此前，IsoPlexis 与Kite公司之间的合作，证明了治疗前抗CD19 CAR-T细胞产品的功能与非霍奇金淋巴瘤患者的客观反应之间存在显著关联。而相关发现发表在了Blood杂志上。

然而，荣誉和行业人士的青睐并不与商业价值划等号。

2022年，受宏观经济逆风和国际环境的影响，IsoPlexis下游客户订购仪器及消耗品的数量下降。2022年全年总收入预计在1660万美元至1680万美元之间，较2021年全年的1730万美元，减少约3%至4%。值得注意的是，CEO Sean Mackay 表示“2022年其客户群在增长”。

大势所趋，2022年时，IsoPlexis做出了战略上的调整，打算与Berkeley Lights 合并，建立一家可持续发展的公司。

Berkeley Lights（以下简称Berkeley）是一家生命科学技术公司，总部位于美国加利福尼亚州。该公司开发了一种名为“光学细胞操作平台”（OptoSelect）的技术，利用光学原理来实现单个细胞的高通量操作和分析。其以Beacon为代表的单细胞光导系统自2016年问世以来，被全球百余家药企、科研机构、CDMO采用。

即便有头部产品坐镇，Berkeley也难逃行业寒潮。2022年，Berkeley全年实现7860万美元收入，较2021年下降8%。

此次，Berkeley Lights以全股票交易形式完成对IsoPlexis的收购，交易金额为5780 万美元。交易完成后，Berkeley Lights股东将拥有合并后公司约75.2%的股份，IsoPlexis股东将拥有合并后公司约24.8%的股份。

两家公司最终能否跨越寒潮，负负得正？

双方将通过多种方式提高合并公司PhenomeX的提高盈利能力并加快实现盈亏平衡：使用成本较低的IsoPlexis平台为Berkeley Lights提供技术支持；交叉双方的客户资源，将Berkeley Lights在生物制药领域的资源与IsoPlexis在学术领域的资源结合；结合双方的研发、供应链/制造基础设施等，提高生产力；扩展产品组合，满足客户的工作流程需求等。

Berkeley预测道：“新公司预计到2024年产生1.5亿美元收入的运营现金流。”