蛋白质是执行生命体功能的重要基本单元,通过复杂的通路网络来行使生物学功能。蛋白质组学研究相对比较复杂,包括蛋白表达水平、翻译后修饰、蛋白间互作、信号及代谢通路的调控和功能等多方面的探究,往往需要借助高通量、大规模的组学方法。
近几年,由于蛋白质组学在疾病诊断和药物开发方面的应用性不断提高,全球蛋白质组学市场显著增长。2020年底开始,Seer、Olink、Nautilius、Quantum-Si、Somalogic等多家提供蛋白质组学技术的生物科技公司陆续上市,资本也开始热切追捧。
相比于国外,国内蛋白质组学市场紧跟形势,已经初步形成了涵盖上游质谱仪器和蛋白质组学试剂供应商、中游蛋白质组学技术服务公司和下游蛋白质应用检测终端客户的完整产业链条,涌现了一批专注于蛋白质组学的优秀企业。
青莲百奥是新一代蛋白质组学平台型企业,致力于蛋白质组学推动的药物研发及精准医学,拥有独特纳米磁珠富集低丰度蛋白技术及蛋白质组学全流程全自动样本处理智能机器人。在全临床样本经验方面,尤其是针对血浆、外泌体等低丰度、超微量临床样本,实现了标志物发现平台和检测平台的一体化。
公司自主研发的新一代DMB workflow(Deep mining beads workflow)蛋白质组学平台,涵盖多功能纳米磁珠富集试剂盒、全自动样本处理仪器设备及全自动大数据分析软件,不仅提供上游工具标准化解决方案,还提供临床质谱的诊疗Biomarker开发服务,从临床需求到诊疗产品落地,提供一站式闭环研发服务。
蛋白质组学的发展路径有着与基因组学相似的发展轨迹,需要创新技术来赋能,解决当前蛋白质组学作为新兴转化医学技术的所有瓶颈,诸如超微量样本、低丰度高异质性信号采集、高通量及自动化的处理工作流、人工智能算法等痛点。
其中低丰度信号采集痛点最为显著。尽管蛋白质组学的分析仪器和计算工具取得了快速发展,但是蛋白质组学中最大的挑战之一,仍然是获取具有超过六个数量级范围的低丰度且高异质性的蛋白质样品。特别是血液蛋白质组,大约拥有1万种不同的蛋白质形态,其动态范围跨越了近1012数量级,并由大量高丰度蛋白质支配,高丰度蛋白含量可高达mg/ml,而低丰度蛋白只有pg/ml。传统富集方法导致大量低丰度蛋白质信号丢失,后续分析数据严重不足,而低丰度蛋白往往才是疾病的特异性生物标记或者药物作用的靶蛋白分子。
基于低丰度蛋白检测难题,青莲百奥自主研发的多功能纳米磁珠富集试剂盒,能够通过不同类型的磁珠,高深度捕获低丰度蛋白,显著提高检测的灵敏度。
同时,青莲百奥还陆续开发了针对蛋白不同维度发挥功能的蛋白富集试剂盒(影响蛋白质行使功能的维度有:蛋白表达水平、翻译后修饰水平、蛋白间互作水平、亚细胞器定位等),囊括了血液类、其他体液类、外泌体、翻译后修饰类、蛋白互作类、空间蛋白质组类、通用蛋白质类等7大产品类别。此外,试剂盒只需要μl级样本起始量,即可高灵敏检测,样本损耗极低,轻松应对临床各类超微量样本。
一份蛋白质组学研究通常包括样本入组、方案设计、临床质谱前处理、LC-MS/MS色谱质谱方法采集、数据检索、数据质控、生物信息分析、数据挖掘等多个步骤。目前国内蛋白组学研究方案主要依赖手工,步骤繁琐耗时,数据质量受到专业处理人员的经验限制。
“因此我们自主研发了国内第一款全自动蛋白质组学样本前处理系统(也可称为蛋白质组学机器人,型号为QLBIO-AP-96),覆盖从临床体液/组织样本蛋白提取富集,到液相色谱-质谱/质谱分析的全流程,通过全流程自动化解决方案助力蛋白质组学研究,推动临床标志物和药物靶点发现及转化。”李京丽表示。
青莲百奥的蛋白质组学机器人拥有磁吸附模块、精准温控模块、微量移液工作站、适配试剂耗材,能够同时完成32例/96例样本的处理,配备一体化友好操作用户界面,可自由编辑处理流程,前处理样本与Thermo、BRUKER、AB Sciex的LC-MS/MS设备的DIA、TMT、LFQ技术方案兼容,实现临床质谱蛋白质样本处理的全自动化和标准化操作。
“如果想开展蛋白质组学研究、想寻找潜在的生物标志物,或是研究疾病的发生机制,只需要把样本放进去,匹配相应功能的纳米磁珠富集试剂盒,等待全自动的数据产出。”李京丽介绍,该蛋白质组学机器人能够将百例样本从传统的10天人工前处理周期缩减至4小时,有助于解决大规模大队列临床样本的制备及稳定性问题。
李京丽还表示,公司的4位联合创始人亲历了20年来蛋白质组学技术的迭代发展,从2周才能检测出1个样本里20个蛋白的数据通量,到今天见证自己平台一天就可以解决10个样品,且每个样本都含有将近万个蛋白数据的通量。这代表着用蛋白阐释生命体变化的机制,对提供重疾防治的解决方案、提高新药研发的原创力,促进生物医药行业的发展都有着重大战略意义。
目前,青莲百奥拥有医院、药企工业等300+家国内重点合作客户,业务涵盖药物靶点发现、疾病标志物筛选、药物表征、IVD产品研发等多个方向。
谈及未来规划,李京丽表示,青莲百奥将秉持以临床问题为导向、以源头创新为核心驱动力,持续用蛋白质组学技术为诊、疗蛋白质生物标志物在临床端和药企端落地转化而努力,真正实现生物标志物发现平台和检测平台的一体化。